《警视厅生物股长》以大日本帝国时期为背景，讲述了一个名叫须藤友三（渡部笃郎 饰）的刑警，被分配到“警视厅总务部总务课动植物管理组”。虽然他渴望回到刑事部门，但又懂得警察组织的规定，所以必须遵守规则。在这里，他和他的新同事们共同面对各种问题，如一只失踪的小熊，一群迷路的野狗，以及各种神秘的情况。同时，他们也经常遭遇恶徒和犯罪团伙，这些事件都让须藤的职业道德变得很敏感。他也明白，这个职位非常不利于他重返刑事部门的想法，为了让他的梦想得到实现，他不得不尽心保护自己和同事们。